Ribomoval^TM rRNA Depletion Kit (Human/Mouse/Rat)

产品简介

转录组测序能全面快速地获得某一物种特定组织或器官在特定状态下的几乎所有转录本序列信息，是研究基因表达调控的主要手段。转录组测序中样品是来源于细胞或组织中经分离的总RNA，包括编码RNA（mRNA）和非编码RNA（ncRNA）。而ncRNA又包括lncRNA、rRNA、tRNA、miRNA和circRNA等。对于转录组分析中的目标RNA(mRNA和LncRNA)，rRNA的数据属于冗余信息，因为rRNA含量占RNA总量的80%以上，且提供的转录本信息非常少，浪费了宝贵的测序数据。所以，在RNA测序的过程当中，首先要解决的问题，是如何去除rRNA。

现有的用于rRNA去除的方法主要有两种。一种是通过DNA探针或者RNA探针杂交捕获rRNA再用链霉亲和素磁珠吸附去除的方法，这种方法称为Ribo-Zero-seq，比如Illumina Ribo-zero和Thermo RiboMinus系列所用的方法。这种方法操作简单，可应用于混合样本，但是需要的样本起始量高（1 μg以上）且对样本的完整性有较高要求，rRNA的残留率也相对比较高，价格昂贵。另一种方法的RNase H消化法，采用特异性的DNA探针与rRNA杂交，利用RNase H能够特异性消化DNA-RNA杂交链中的RNA单链，而未与探针杂交的mRNA，lncRNA等不受影响，从而富集目标RNA。该方法需要的样本起始量比较低（低至100 ng）且可适用于部分降解的样本，而且rRNA的残留率比方法一要低，价格相对便宜。吉赛生物的新品核糖体RNA去除试剂盒采用的方法是RNase H消化法，能够高效去除核糖体RNA。