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表观遗传学研究

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目标区域甲基化测序

Bisulfite(亚硫酸氢盐)处理是表观遗传学研究的经典实验方法,能够将基因组中未甲基化的胞嘧啶转化成尿嘧啶,通过PCR进一步转化成胸腺嘧啶,而甲基化的胞嘧啶保持不变。目标区域甲基化测序(Targeted Region Bisulfite Sequencing)首先将Bisulfite处理基因组DNA,然后在目标区域两侧设计PCR引物并对目标区域进行扩增,对PCR扩增产物进行测序就可以判断目标区域CpG位点是否发生甲基化修饰。

全基因组甲基化测序成本相对昂贵,目标区域甲基化测序只需针对感兴趣的区域进行研究,设计一对引物就可同时检测该区域内多个CpG位点,不仅大大降低了甲基化研究的成本,还能提高目标区域的测序深度,从而增加检测准确性,获得检测区域的单碱基分辨率的甲基化信息。可用于研究特定DNA区域甲基化与特定表型之间的关联,与转录组测序结合还有助于甲基化修饰对基因表达调控机制的研究。

建库方法及技术流程

技术优势

  • 500~1000X高测序深度,精确计算每个位点C的甲基化程度

  • 一次检测大量样本

  • 高通量,同时检测多个区域多个位点

结果展示


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