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互作转录组测序

物种间存在广泛的相互作用,包括寄生、共生、竞争等,而普通的转录组只能研究单一物种的信息,不仅浪费一部分数据,而且在分离中也会对样本本身造成一定的影响。

互作转录组(Dual RNA-seq),无需分离两物种,避免分离造成的干扰,只构建一个转录组文库,便能同时对2个(或多个)物种进行测序和分析,从而揭示互作物种间基因表达的动态变化。同时,还可以通过互作模型图获得物种间基因的调控关系,得到两物种间的相互作用机制。研究互作过程中的调控网络、病原菌感染宿主致病机理和宿主抗病的机制;研究致病性菌在不同物种之间的进化关系、基于同源基因进一步发掘正选择相关基因等。

建库方法及技术流程

技术优势

  • Digital(UMI)高通量测序服务平台,自主研发建库技术,有效降建库低起始量;

  • 结合数字标签(UMI)技术,提高比对率、解决PCR偏好性对中低表达量基因的影响,让表达量分析精确度更上一个台阶;

  • UMI技术帮助研究超低表达量基因:避免寄生物种信息被宿主掩盖、有利于病原体感染初期检测;

  • 强大的生信分析团队,提供多种个性化分析;

  • 从方案设计、建库测序到数据挖掘,贴心全程陪伴,全力帮助您的研究。

结果展示


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