转录因子ChIP测序

ChIP测序（Chromatin immunoprecipitation and high-throughput sequencing，ChIP-seq）是将染色质免疫沉淀与高通量测序相结合的技术，通过蛋白免疫相互作用，用抗体把和染色质相互作用的蛋白（如转录因子等）沉淀下来，捕捉到细胞内动态的、瞬时的蛋白质与DNA之间的相互作用，从而所获取与其相结合的DNA序列，确定各种转录因子以及染色体结合蛋白在染色质上的具体位置。可以一次性得到目的蛋白在整个基因组上的结合分布，得到目的蛋白精确的结合位点以及结合基序等信息。

若同时辅以转录组测序，则可以帮助得到目的蛋白对全细胞基因表达的调控模式，大幅提高对目的蛋白的功能认识。这种在 DNA－蛋白质相互作用研究方法上的重大突破，极大的推进了基因表达调控的发展。

建库方法及技术流程

结果展示

A：IP质检结果（input：样品裂解液中目的蛋白检测结果，IP：抗体富集目的蛋白检测结果，IgG：IgG富集目的蛋白结检测果）；

B：Reads在基因上下游的分布，结合峰主要位于转录起始位点（TSS）上游区域（ChIP_1/2/3为3个生物学重复）；

C：Peak在基因组各功能区的分布；

D：Peak的Motif分析。