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微生物研究

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绝对定量16S rDNA测序

细菌rRNA(核糖体RNA)按沉降系数可分为3种,分别为5S、16S以及23S rRNA。16S rRNA为核糖体RNA的一个亚基,16S rDNA即编码该亚基的基因。16S rDNA序列包含10个保守区域和9个可变区域,保守区在细菌间差异不大,高变区具有属或种的特异性。对V4可变区进行测序,可对环境(如土壤、水源、皮肤、肠道等)的微生物多样性进行分析。获得的物种分类、物种丰度、种群结构、系统进化、群落比较等信息对环境中微生物组成及进化、微生态研究有重要指导作用。

建库方法及技术流程

结果展示

基于分类等级树的组间差异分类单元展示 Krona的分类学组成信息交互展示

对3组共9个样品分别使用普通16S rDNA测序和绝对定量16S rDNA测序,进行相关性和聚类分析。

结果说明:

普通16S rDNA测序无法区分A组和B组样品,绝对定量16S rDNA测序能将A、B、C组内的所有样品较好的聚类,组间差异显著,说明该方法更能反映样品真实分组情况,且样品重复性效果较好。(Pearson相关系数表示两个样品间线性相关强弱的程度,其绝对值越大表明相关性越强。)



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